自动化显微镜图像采集

15.05.23

适用于高级成像单元的简单开源软件解决方案

并非所有实验室或研究项目都能幸运地得到大笔的预算、经费或者资助。对于许多科学家和实验室技术人员来说，类似的困境可能限制其开发先进的自动化显微镜和图像采集系统，而这些系统往往具有更高的成本效益，并且能够提供满足每个研究项目所需的结果质量。

在实践中，构建和控制一套自动化显微镜系统所需的各个部件通常来自不同制造商，或者是由新购买的部件与现有部件组合而成的，尤其是在经费紧张的情况下。例如，一套常见的系统可能包含来自领先制造商之一的显微镜，以及围绕其构建的图像采集系统。整套系统也可以由来自多家供应商的设备，比如自动多轴（x/y/z）载物台、光源、电动滤光片转盘、光阑、相机和镜子等等构成。

这其中的挑战往往在于开发能够将这些组装设备视为集成且连贯的系统的控制软件，以便充分利用每个组件的潜力来生成高质量、可重复的准确图像。特别是当研究人员需要执行复杂的成像流程时更是如此，例如在多波长光谱下捕获样本的图像。

当然，领先的显微镜制造商也提供了软件。但是这些产品都是专有的，并且通常缺少必要的驱动程序或功能来接入和控制来自其他供应商的各种运动和成像设备。即使有可用的选项，往往价格非常昂贵并且需要专门的技术支持。

这就是开源控制与图像采集软件（如Micromanager）以及图像分析软件（如ImageJ）的用武之地了。

开源图像采集软件

Micromanager和ImageJ是专门为了让研究科学家和实验室技术人员能够为显微镜自动化和图像采集与分析系统构建精细复杂的控制软件而开发的。Micromanager可兼容Windows、Linux和Mac操作系统，使用简单的脚本和动态编程语言，可以简单、快速地为显微镜、相机和自动化设备创建独立的硬件接口，然后在增加或更换组件时对其进行修改、更新或扩展。

Micromanager的内置功能可适用于大多数常见的实验室成像任务，同时还可以轻松地开发新颖的成像程序、扩展功能和专门的成像应用。例如，其中可以包含延时、多通道、z-stack和快速流式传输等，然后利用ImageJ无缝整合以进行详细的图像分析。还可以为第三方产品添加编程接口，例如Matlab。

Micromanager和ImageJ都有科学和学术界以及我们内部专家团队的广泛技术支持

降低实验室图像采集成本

在Prior Scientific，我们投入了大量时间和资源进行产品开发，目标是使我们的显微镜自动化和纳米定位系统尽可能地易于使用，同时提供最高标准的精度、可重复性和可靠性。关键点之一是我们专注于控制器和接口设备的开发，以便能够保证与最常用的成像软件直接集成。这其中也包括Micromanager。

最重要的是，Micromanager和ImageJ的优势在于它们能够帮助您降低开发复杂显微镜自动化和图像采集与分析系统的成本。与此同时，这些产品简单、易于编程和功能强大的特点也将让您能够在不牺牲图像分辨率、运动速度和复杂度、系统可靠性和可重复性或研究工作质量的情况下最大限度地降低成本。

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